Postępowanie mające na celu niszczenie patogenów znajdujących się na narzędziu. Dezynfekcję należy wykonywać regularnie i w zależności od stopnia zanieczyszczenia można wykonać sanityzację, dezynfekcję lub sterylizację. Działanie to dotyczy także ubrań ochronnych, uli i innych narzędzi, które mają związek z działalnością pszczelarską.